不影响使用，你把移动硬盘标记为活动了，那么如果你在上面装个系统的话可以直接启动进入移动硬盘的系统。首先，电脑系统的引导器是安装于活动主分区上面的，而且一块硬盘必须要有一个主分区处于活动状态才能启动得了。电脑的启动过程：BIOS加电-->BIOS自检-->硬件检测-->按BIOS里设置好的启动须序搜寻可启动介质（如硬盘、光盘、U盘、网络等）-->加载可启动介质的引导记录（磁盘上称为MBR）-->根据MBR搜寻启动文件（一般windows系统的系统文件，如NTLDR、BOOTMGR是位于活动主分区的，而winPE等则不然）。
